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青海新聞網(wǎng)·大美青海客戶端訊（記者 張小千 報(bào)道）近日，記者從青海省科技廳獲悉，由青海省科技廳重點(diǎn)研發(fā)與轉(zhuǎn)化計(jì)劃專項(xiàng)支持的青海大學(xué)青海省昆侖英才農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)（青藏高原昆蟲生態(tài)與害蟲防治團(tuán)隊(duì)），在自然科學(xué)期刊《Scientific Data》（科學(xué)數(shù)據(jù)）上發(fā)表學(xué)術(shù)論文《Genome assembly of the grassland caterpillar Gynaephora qinghaiensis》（青海草原毛蟲基因組組裝）。
草原毛蟲（Lepidoptera：Lymantriinae：Gynaephora）是一個(gè)小型昆蟲類群，全世界記錄有15個(gè)物種，分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區(qū)。在中國(guó)，所有8個(gè)被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900米至5000米的青藏高原地區(qū)。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲，不僅取食牧草可導(dǎo)致嚴(yán)重的飼草短缺和草地退化，還會(huì)引起家畜和野生動(dòng)物的口腔黏膜潰瘍。
研究組就青海草原毛蟲（Gynaephora qinghaiensis）的基因組進(jìn)行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04Mb，由107個(gè)contig組成，contig N50大小為18.65Mb。BUSCO分析顯示，組裝體中含有99.56%（99.27%完整、0.29%片段化）的BUSCO基因。在G.qinghaiensis基因組中，預(yù)測(cè)有580.2Mb（占基因組的67.4%）的重復(fù)序列和16 618個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)分析表明，G.qinghaiensis與銹色卷蛾Orgyia antiqua大約在1830萬(wàn)年前分化。此外，基因家族進(jìn)化分析表明，在G.qinghaiensis基因組中，有130個(gè)基因家族顯著擴(kuò)張、43個(gè)基因家族收縮。參考基因組的可用性，可為揭示草原毛蟲對(duì)高海拔環(huán)境的適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制提供遺傳資源，有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。